品質控制是品質的檢測環節。它抽取原料、半成品和成品的樣品，並對照規格進行檢驗。如果某個批次不合格，則會被拒收。品質控制是一種被動的機制，因為它是在問題發生後才發現並解決的，但它至關重要。如果沒有品質控制，缺陷產品可能會流入患者手中。
在製藥生產中，品質控制實驗室負責檢測藥品的鑑別、效價、純度和溶離度。他們採用高效液相層析法、質譜法和微生物檢測等方法。每種方法都必須經過驗證，以確保其準確性和可靠性。品質控制部門也會監測無塵室的環境條件，檢測空氣和表面是否有微生物污染。穩定性測試也是品質控制的一部分，旨在確認藥品在其有效期內始終符合規格。如果某個批次出現問題，則會展開調查以確定原因，並採取糾正措施。
品質控制測試項目：
- Identity. 是否有正確的活性成分？
- Strength. 劑量是否在規格範圍內？
- 純度. 是否存在超過允許限值的雜質？
- 溶解度. 藥物是否以預期的速度溶解？
- 穩定性. 藥物是否能在一段時間內保持符合規格？
品質控制（QC）和品質保證（QA）共同構成品質系統。品質控制負責發現問題，品質保證負責預防問題。
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