Pengendalian mutu adalah sisi pengujian dari kualitas. Tahap ini mengambil sampel bahan baku, bahan dalam proses, dan produk jadi, lalu memeriksanya sesuai spesifikasi. Jika suatu batch gagal, maka batch tersebut ditolak. Pengendalian mutu bersifat reaktif karena mendeteksi masalah setelah terjadi, tetapi sangat penting. Tanpa itu, produk cacat dapat sampai ke pasien.

Dalam manufaktur farmasi, laboratorium QC menguji identitas, kekuatan, kemurnian, dan disolusi. Mereka menggunakan metode seperti kromatografi cair kinerja tinggi, spektrometri massa, dan uji mikrobiologi. Setiap metode harus divalidasi untuk memastikan keakuratan dan keandalannya. QC juga memantau kondisi lingkungan di ruang bersih, menguji udara dan permukaan untuk kontaminasi mikroba. Pengujian stabilitas merupakan bagian dari QC, yang memastikan bahwa obat tetap sesuai spesifikasi selama masa simpannya. Jika suatu batch gagal, investigasi akan menentukan penyebabnya, dan tindakan korektif akan diambil.

Apa saja yang diuji oleh QC:

• Identitas.
• Kekuatan.
• Kemurnian.
• Pelarutan.
• Stabilitas.

QC dan QA bersama-sama membentuk sistem mutu. QC menemukan masalah; QA mencegahnya.