Η πολυκαλλιέργεια είναι το αντίθετο της μονοκαλλιέργειας. Αντί για μία καλλιέργεια σε μια μεγάλη έκταση, πολλά είδη αναπτύσσονται μαζί στον ίδιο αγρό. Οι συνδυασμοί μπορεί να είναι απλοί, όπως το καλαμπόκι και τα φασόλια, ή σύνθετοι, όπως ένας τροπικός κήπος με δεκάδες είδη σε στρώσεις από το θόλο μέχρι το έδαφος.

Τα παραδοσιακά γεωργικά συστήματα σε όλο τον κόσμο είναι ως επί το πλείστον πολυκαλλιέργειες. Η Milpa της Μεσοαμερικής, τα συστήματα ρυζιού-ψαριού της Κίνας και οι κήποι της Ιάβας συγκεντρώνουν όλα πολλά είδη σε έναν μικρό χώρο. Κάθε φυτό χρησιμοποιεί μια διαφορετική θέση και τα παράσιτα δυσκολεύονται να βρουν τον ξενιστή τους όταν περιβάλλονται από άλλα είδη.

Γιατί το χρησιμοποιούν οι αγρότες

• Κατανέμει τον κίνδυνο σε πολλαπλές καλλιέργειες
• Χρησιμοποιεί το φως, το νερό και το έδαφος πιο αποτελεσματικά
• Μειώνει την πίεση από παράσιτα και ασθένειες
• Βελτιώνει την κάλυψη του εδάφους και μειώνει τη διάβρωση

Η πολυκαλλιέργεια είναι πιο δύσκολο να μηχανοποιηθεί. Η συγκομιδή είναι ιδιότροπη και τα χημικά που στοχεύουν μια καλλιέργεια μπορεί να βλάψουν μια άλλη. Αυτός είναι ο λόγος για τον οποίο κυριαρχεί στις μικρές εκμεταλλεύσεις και δυσκολεύεται στις μεγάλες, αν και η καλλιέργεια σε ζώνες και η ενδοκαλλιέργεια βρίσκουν θέση στα βιομηχανικά συστήματα.