生物燃料是指由近期存活的生物質材料製成的任何燃料。木材、作物殘渣、藻類和動物糞便都屬於此類。此類別包括乙醇、生物柴油、沼氣和固體生物質顆粒。它們的共同點在於，燃料中的碳來自近期大氣，而非數百萬年前形成的地下沉積物。

生物燃料分為幾代。第一代燃料來自玉米和甘蔗等糧食作物。第二代燃料使用非糧食作物來源，例如秸稈、木屑和能源草。第三代燃料來自藻類。每一代都力求避免前一代存在的問題。

其目標是實現碳中和。植物在生長過程中會吸收二氧化碳，而燃燒燃料則會釋放出來。理論上，淨排放量為零。但實際上，農業、加工和運輸都需要能源，而這些能源往往來自化石燃料。真正的碳平衡取決於燃料的生產方式。有些生物燃料能顯著減少排放，而有些則幾乎無濟於事。

常用生物燃料

• 玉米或甘蔗製乙醇
• 利用油脂生產生質柴油
• 利用廢料產生的沼氣
• 木屑顆粒
• 藻類燃料