Mikorrhiza, bir mantar ile bitki kökü arasındaki ortaklıktır. Mantar toprakta ilerleyerek su ve besin maddelerini toplar ve bunları fotosentez yoluyla üretilen şekerlerle bitkiye aktarır. Bu düzenleme çok eski olup 400 milyon yıldan daha eski bir geçmişe sahiptir ve karada yaşayan bitkilerin çoğu bu yapıyı oluşturur.

İki ana türü vardır. Arbusküler mikorizalar kök hücrelerine nüfuz eder ve otlarda, sebzelerde ve çoğu tarla bitkisinde yaygındır. Ektomikorizalar kök uçlarını sarar ve çam, meşe ve huş ağacı gibi ağaçlarda tipiktir. Mantar ağı, köklerin erişemeyeceği kadar genişleyebilir ve bitkinin beslenme alanını etkili bir şekilde çoğaltabilir.

Bitkinin kazandığı

• Özellikle düşük verimli topraklarda fosfor alımının iyileştirilmesi
• Kurak dönemlerde suya daha iyi erişim
• Bazı kök patojenlerine karşı daha yüksek direnç
• Mantar hifleri yoluyla toprak agregasyonunun iyileştirilmesi

Her tarım yöntemi mikoriza mantarlarını desteklemez. Yüksek fosforlu gübre kullanımı, sık toprak işleme ve nadas dönemleri mikoriza popülasyonlarını azaltır. Daha az toprak işleme, örtü bitkileri ve düşük girdi gerektiren sistemler ise mikoriza mantarlarını daha iyi destekler.