Odczyt pojedynczego fragmentu DNA stał się wąskim gardłem. Sekwencjonowanie nowej generacji, czyli NGS, masowo paralelizuje ten proces, generując miliony, a nawet miliardy krótkich odczytów w jednym przebiegu. Technologia ta obniżyła koszty sekwencjonowania o rzędy wielkości.
Powszechne platformy wykorzystują sekwencjonowanie przez syntezę lub inne metody cykliczne na klonalnie amplifikowanych matrycach. Zastosowania obejmują sekwencjonowanie całego genomu, całego eksomu, transkryptomu i sekwencjonowanie paneli docelowych. Potoki bioinformatyczne wyrównują odczyty i nazywają warianty względem odniesienia.
NGS zrewolucjonizowała diagnostykę kliniczną, genomikę nowotworów i badania populacyjne. Interpretacja wariantów o niepewnym znaczeniu i zarządzanie dużymi wolumenami danych wciąż stanowią wyzwanie. Nowsze technologie długich odczytów uzupełniają NGS krótkich odczytów, umożliwiając analizę złożonych regionów i wariantów strukturalnych.
- Wysokoprzepustowe równoległe sekwencjonowanie DNA
- Generuje miliony odczytów na przebieg
- Umożliwia analizę całego genomu i analizę ukierunkowaną
- Podstawy nowoczesnej medycyny genomicznej
Comments
No comments yet. Be the first to share a thought.
Leave a comment