Thụ phấn chéo là quá trình chuyển phấn hoa từ hoa của cây này sang nhụy hoa của cây khác cùng loài, dẫn đến sự tái tổ hợp gen ở thế hệ con. Nó trái ngược với tự thụ phấn, trong đó phấn hoa được chuyển trong cùng một bông hoa hoặc cây. Thụ phấn chéo được thực hiện bởi các tác nhân sinh học như ong, bướm, sâu bướm, chim và dơi, hoặc bởi các tác nhân phi sinh học bao gồm gió và nước. Nhiều loại cây trồng – bao gồm táo, lê, hạnh nhân, dưa chuột, bí và cải dầu – phụ thuộc vào thụ phấn chéo để có năng suất và khả năng đậu quả tốt, và người trồng thường trồng các giống thụ phấn hoặc đặt tổ ong mật. Các cơ chế thúc đẩy thụ phấn chéo bao gồm tự bất thụ, dị phối (thời điểm phát triển cơ quan sinh dục đực và cái không đồng đều) và dị hình hoa (hình dạng hoa khác nhau). Thụ phấn chéo làm tăng sự đa dạng di truyền, điều này rất quan trọng cho sự thích nghi và lai tạo cây trồng. Tuy nhiên, nó cũng có thể gây ra sự trao đổi gen không mong muốn giữa các loại cây trồng thông thường, hữu cơ và biến đổi gen, làm dấy lên lo ngại về độ tinh khiết của hạt giống và sự cùng tồn tại.