पर-परागण वह प्रक्रिया है जिसमें एक पौधे के फूल से परागकण उसी प्रजाति के दूसरे पौधे के फूल के वर्तिकाग्र तक स्थानांतरित होते हैं, जिसके परिणामस्वरूप संतान में आनुवंशिक पुनर्संयोजन होता है। यह स्व-परागण से भिन्न है, जिसमें परागकण एक ही फूल या पौधे के भीतर स्थानांतरित होते हैं। पर-परागण मधुमक्खियों, तितलियों, पतंगों, पक्षियों और चमगादड़ों जैसे जैविक कारकों या हवा और पानी जैसे अजैविक कारकों द्वारा सुगम होता है। सेब, नाशपाती, बादाम, खीरा, कद्दू और तिलहन सहित कई फसलें अच्छी फल प्राप्ति और उपज के लिए पर-परागण पर निर्भर करती हैं, और किसान अक्सर परागणकारी किस्में लगाते हैं या मधुमक्खी के छत्ते लगाते हैं। पर-परागण को बढ़ावा देने वाले तंत्रों में स्व-असंगतता, द्विगुणन (नर और मादा अंगों का अलग-अलग समय पर विकास) और विषमगुणन (फूलों के विभिन्न रूप) शामिल हैं। पर-परागण आनुवंशिक विविधता को बढ़ाता है, जो फसल अनुकूलन और प्रजनन के लिए महत्वपूर्ण है। हालांकि, यह पारंपरिक, जैविक और आनुवंशिक रूप से संशोधित फसलों के बीच अवांछित जीन प्रवाह का कारण भी बन सकता है, जिससे बीज की शुद्धता और सह-अस्तित्व के बारे में चिंताएं बढ़ जाती हैं।