Büyük ölçekli paralel işleme makinelerinden önce, DNA dizisi tek tek parçalar halinde okunuyordu. Sanger dizileme yöntemi, her olası pozisyonda sonlanan iç içe geçmiş DNA zincirleri oluşturmak için zincir sonlandırıcı dideoksinükleotidler kullanır. Parçalar boyutlarına göre ayrıldığında, bazların sırası çıkarılabilir.
Dört sonlandırıcının her biri farklı bir floresan boya taşır. Kılcal elektroforez cihazı, parçalar bir lazerden geçerken son bazın rengini algılar ve renkli piklerden oluşan bir kromatogram üretir. Bu yöntem, yaklaşık bin baza kadar olan okumalar için oldukça doğrudur.
Yeni nesil platformlar büyük projelerde baskın konumda olsa da, Sanger dizileme yöntemi bireysel varyantların doğrulanması ve kısa hedefli bölgelerin dizilenmesi için altın standart olmaya devam etmektedir. Birçok klinik laboratuvar, güvenilirliği ve kolay yorumlanabilirliği nedeniyle hala bu yönteme güvenmektedir.
- Klasik zincir sonlandırma sekanslama yöntemi
- Floresan dideoksinükleotidler kullanır.
- Orta uzunluktaki verilerin doğru bir şekilde okunmasını sağlar.
- Hâlâ doğrulama ve hedefli analiz için kullanılıyor.
Comments
No comments yet. Be the first to share a thought.
Leave a comment