अत्यंत समानांतर मशीनों से पहले, डीएनए अनुक्रम को एक-एक खंड करके पढ़ा जाता था। सैंगर अनुक्रमण में श्रृंखला-समाप्त करने वाले डाइडिऑक्सीन्यूक्लियोटाइड का उपयोग करके डीएनए स्ट्रैंड के ऐसे समूह उत्पन्न किए जाते हैं जो हर संभव स्थिति पर समाप्त होते हैं। जब खंडों को आकार के अनुसार अलग किया जाता है, तो क्षारों का क्रम ज्ञात किया जा सकता है।

चारों टर्मिनेटरों में से प्रत्येक में एक अलग फ्लोरोसेंट डाई होती है। एक केशिका इलेक्ट्रोफोरेसिस उपकरण लेजर से गुजरते समय अंतिम बेस के रंग का पता लगाता है, जिससे रंगीन चोटियों का एक क्रोमैटोग्राम बनता है। यह विधि लगभग एक हजार बेस तक की रीडिंग के लिए अत्यधिक सटीक है।

यद्यपि अब अगली पीढ़ी के प्लेटफॉर्म बड़े प्रोजेक्टों में प्रमुख भूमिका निभा रहे हैं, फिर भी व्यक्तिगत वेरिएंट को प्रमाणित करने और छोटे लक्षित क्षेत्रों की सीक्वेंसिंग के लिए सैंगर सीक्वेंसिंग सर्वोपरि है। कई नैदानिक ​​प्रयोगशालाएँ इसकी विश्वसनीयता और सरल व्याख्या के कारण आज भी इस पर निर्भर हैं।

• क्लासिक चेन-टर्मिनेशन सीक्वेंसिंग विधि
• फ्लोरोसेंट डाइडिऑक्सीन्यूक्लियोटाइड का उपयोग करता है
• मध्यम लंबाई के सटीक परिणाम उत्पन्न करता है
• इसका उपयोग अभी भी सत्यापन और लक्षित विश्लेषण के लिए किया जाता है।