대규모 병렬 처리 장비가 등장하기 전에는 DNA 서열을 한 번에 한 조각씩 읽었습니다. 생거 시퀀싱은 사슬 종결 디데옥시뉴클레오티드를 사용하여 모든 가능한 위치에서 끝나는 중첩된 DNA 가닥 세트를 생성합니다. 이렇게 생성된 조각들을 크기에 따라 분리하면 염기 순서를 추론할 수 있습니다.
네 개의 종결자 각각에는 서로 다른 형광 염료가 부착되어 있습니다. 모세관 전기영동 장비는 조각들이 레이저를 통과할 때 최종 염기의 색을 감지하여 색깔이 있는 피크로 이루어진 크로마토그램을 생성합니다. 이 방법은 약 1,000개 염기까지 매우 정확하게 판독할 수 있습니다.
차세대 플랫폼이 대규모 프로젝트를 주도하고 있지만, Sanger 시퀀싱은 개별 변이 검증 및 짧은 표적 영역 시퀀싱에 있어 여전히 표준으로 여겨집니다. 많은 임상 연구실에서는 Sanger 시퀀싱의 신뢰성과 간편한 해석을 이유로 여전히 이를 활용하고 있습니다.
- 고전적인 사슬 종결 시퀀싱 방법
- 형광 디데옥시뉴클레오티드를 사용합니다.
- 적당한 길이의 데이터를 정확하게 읽어냅니다.
- 검증 및 표적 분석에 여전히 사용됩니다.
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