Før massivt parallelle maskiner blev DNA-sekvenser aflæst ét ​​fragment ad gangen. Sanger-sekventering bruger kædeterminerende dideoxynukleotider til at generere indbyggede sæt af DNA-strenge, der ender på enhver mulig position. Når fragmenterne er adskilt efter størrelse, kan basernes rækkefølge udledes.

Hver af de fire terminatorer bærer et forskelligt fluorescerende farvestof. Et kapillærelektroforeseinstrument detekterer farven på den endelige base, når fragmenterne passerer en laser, hvilket producerer et kromatogram af farvede toppe. Metoden er meget nøjagtig for aflæsninger på op til cirka tusind baser.

Selvom næstegenerationsplatforme nu dominerer store projekter, er Sanger-sekventering fortsat guldstandarden til validering af individuelle varianter og sekventering af korte, målrettede regioner. Mange kliniske laboratorier er stadig afhængige af den på grund af dens pålidelighed og ligefremme fortolkning.

• Klassisk kædetermineringssekventeringsmetode
• Bruger fluorescerende dideoxynukleotider
• Producerer nøjagtige aflæsninger af moderat længde
• Bruges stadig til validering og målrettet analyse