कुछ प्रजातियाँ सर्वत्र पाई जाती हैं। अन्य प्रजातियाँ केवल एक ही स्थान पर पाई जाती हैं और कहीं नहीं। ये स्थानिक प्रजातियाँ हैं, जो प्राकृतिक रूप से केवल एक विशिष्ट क्षेत्र में ही पाई जाती हैं। यह क्षेत्र विशाल हो सकता है, जैसे कि एक महाद्वीप, या छोटा, जैसे कि एक पर्वत शिखर या गुफा। द्वीपों, एकांत झीलों और पर्वत शिखरों पर स्थानिकता आम है, जहाँ आबादी इतने लंबे समय तक अलग रही है कि वे विशिष्ट रूपों में विकसित हो गई हैं। मेडागास्कर इसका एक उत्कृष्ट उदाहरण है। इसके लगभग 90 प्रतिशत वन्यजीव पृथ्वी पर कहीं और नहीं पाए जाते हैं, जिनमें सभी लेमूर और अधिकांश ऑर्किड शामिल हैं।

स्थानिक प्रजातियाँ अक्सर खतरे में होती हैं। उनका सीमित क्षेत्र उन्हें किसी एक खतरे, जैसे कि तूफान, आग या किसी आक्रामक शिकारी के कारण विलुप्त होने से बचा सकता है। द्वीपीय प्रजातियाँ मुख्य भूमि के कई शिकारियों के बिना विकसित हुई हैं और अक्सर उनमें रक्षा तंत्र की कमी होती है। मॉरीशस में पाई जाने वाली उड़ने में असमर्थ पक्षी डोडो, मानव आगमन के एक सदी के भीतर ही विलुप्त हो गई। आवास का नुकसान, जलवायु परिवर्तन और बाहरी प्रजातियों का प्रवेश आज भी स्थानिक प्रजातियों के लिए खतरा बना हुआ है। उनकी रक्षा का अर्थ आमतौर पर उनके निवास स्थान की रक्षा करना होता है, जिससे संरक्षण एक वैश्विक मुद्दा होने के साथ-साथ एक स्थानीय मुद्दा भी बन जाता है।

जहां स्थानिक प्रजातियों की संख्या अधिक है

• द्वीप समूह: मेडागास्कर, हवाई, गैलापागोस।
• प्राचीन झीलें: बैकाल झील, मलावी झील।
• पर्वतों की चोटियाँ: रॉकी और एंडीज़ पर्वतों में आकाश के द्वीप।
• गुफाएं और एकांत झरने।

स्थानिक प्रजातियाँ अपूरणीय होती हैं। एक बार वे लुप्त हो गईं, तो वे केवल स्थानीय स्तर पर ही नहीं, बल्कि हर जगह से लुप्त हो गईं।