Τα περισσότερα χρωμοσώματα μοιάζουν ίδια στα αρσενικά και τα θηλυκά. Τα φυλετικά χρωμοσώματα αποτελούν εξαίρεση. Διαφέρουν μεταξύ των φύλων και φέρουν τα πρωταρχικά σήματα που καθορίζουν τη σεξουαλική ανάπτυξη. Στους ανθρώπους το ζεύγος είναι XX στα θηλυκά και XY στα αρσενικά.

Το χρωμόσωμα Χ είναι μεγάλο και πλούσιο σε γονίδια. Το Υ είναι μικρότερο και φέρει το γονίδιο SRY που πυροδοτεί την ανάπτυξη των αρσενικών. Άλλα είδη χρησιμοποιούν διαφορετικά συστήματα—για παράδειγμα, το ZW στα πτηνά. Τα φυλετικά χρωμοσώματα εξελίχθηκαν από τα συνηθισμένα αυτοσωμικά και εξακολουθούν να μοιράζονται υπολειμματική ομολογία σε μικρές ψευδοαυτοσωμικές περιοχές που ζευγαρώνουν κατά τη μείωση.

Τα γονίδια στα φυλετικά χρωμοσώματα εμφανίζουν διακριτά πρότυπα κληρονομικότητας. Οι μηχανισμοί αντιστάθμισης δοσολογίας εξισορροπούν την έκφραση γονιδίων που συνδέονται με το Χ μεταξύ αρσενικών και θηλυκών. Οι ανωμαλίες στον αριθμό των φυλετικών χρωμοσωμάτων προκαλούν καταστάσεις όπως τα σύνδρομα Turner και Klinefelter. Η μελέτη αυτών των χρωμοσωμάτων αποκαλύπτει τόσο τους μηχανισμούς του προσδιορισμού του φύλου όσο και την εξελικτική ιστορία του φυλετικού διμορφισμού.

• Χρωμόσωμα που εμπλέκεται στον προσδιορισμό του φύλου
• Σύστημα XX/XY στους ανθρώπους
• Το Χ είναι μεγάλο και πλούσιο σε γονίδια. Το Υ φέρει SRY.
• Δείχνει μοναδικές επιδράσεις κληρονομικότητας και δοσολογίας