有些性狀會隱藏數代，然後突然顯現。隱性性狀只有在個體攜帶兩個隱性等位基因時才會表現出來。在顯性等位基因存在的情況下，隱性等位基因不會產生任何可見的影響。

在某些人群中，藍眼睛、許多代謝性疾病和囊性纖維化都遵循這種模式。雜合子攜帶者本身健康，但可以遺傳該等位基因。當兩個帶因者生育子女時，每次懷孕都有25%的機率生下患病的純合子孩子。

系譜分析常顯示此性狀隔代遺傳，並在近親結婚後出現。分子檢測可以在帶原者生育子女之前識別出他們。了解隱性遺傳有助於家庭評估風險，並指導新生兒篩檢項目，從而及早發現可治療的疾病。

• 僅由兩個隱性等位基因表達
• 隱藏在雜合子攜帶者中
• 系譜中可以隔代遺傳
• 父母雙方均為帶原者時，風險為25%。