沿海生态系统，例如红树林、海草床和盐沼，会以远超陆地森林的速度将有机碳埋藏在土壤中。这种储存的碳被称为蓝碳。由于沉积物常年处于水饱和状态且氧气含量低，分解速度缓慢，这些碳可以被封存数百年之久。

因此，保护​​和恢复这些栖息地具有双重益处：既能保护生物多样性，又能减缓气候变化。当生态系统退化时，储存的碳会以二氧化碳的形式释放回大气中。准确核算蓝碳储量正逐渐成为国家气候战略和碳市场项目的重要组成部分。

研究重点在于测量碳埋藏速率，了解碳离开沿海地区后的去向，并量化海岸保护和渔业支持带来的额外效益。蓝碳计划若能同时解决导致栖息地丧失的当地社会和经济因素，则效果最为显著。

健康的海草床可以年复一年地在其沉积物中积累碳，而表面却几乎没有可见的变化。