利用电场可以分离不同长度的DNA片段。凝胶电泳将带电分子拉过多孔凝胶基质；较小的片段比大的片段迁移得更快。最终形成一系列条带，这些条带揭示了样品中存在的片段大小。

琼脂糖凝胶用于分离较大的DNA片段；聚丙烯酰胺凝胶则用于分离较小的片段。DNA用荧光染料或染色剂进行显色。通过与分子量标准进行比较，可以估算片段长度。该技术是限制性酶切图谱构建、PCR分析和测序文库质量控制的基础。

尽管在高通量实验中，毛细管电泳和微流控技术已基本取代了平板凝胶电泳，但它仍然是一种简单、经济的教学和科研工具。合适的电压、凝胶浓度和运行时间决定了分辨率。该方法是分子生物学实验室的基础技术。

• 按大小分离DNA片段
• 利用电场和多孔凝胶
• 较小的碎片传播得更远。
• 利用荧光染料进行可视化