अलग-अलग लंबाई के डीएनए खंडों को विद्युत क्षेत्र की सहायता से अलग किया जा सकता है। जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस में आवेशित अणुओं को छिद्रयुक्त जेल मैट्रिक्स से गुजारा जाता है; छोटे खंड बड़े खंडों की तुलना में तेजी से गति करते हैं। इसके परिणामस्वरूप बैंड की एक श्रृंखला बनती है जो नमूने में मौजूद आकारों को दर्शाती है।

बड़े डीएनए टुकड़ों के लिए एगारोज जैल का उपयोग किया जाता है; पॉलीएक्रिलामाइड जैल छोटे टुकड़ों को अलग करते हैं। डीएनए को फ्लोरोसेंट रंगों या दागों की सहायता से देखा जाता है। आकार मानक से तुलना करके टुकड़े की लंबाई का अनुमान लगाया जा सकता है। यह तकनीक रिस्ट्रिक्शन मैपिंग, पीसीआर विश्लेषण और सीक्वेंसिंग लाइब्रेरी के गुणवत्ता नियंत्रण का आधार है।

उच्च-थ्रूपुट कार्यों के लिए केशिका और माइक्रोफ्लुइडिक विधियों द्वारा प्रतिस्थापित किए जाने के बावजूद, स्लैब-जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस एक सरल, सस्ता शिक्षण और अनुसंधान उपकरण बना हुआ है। उचित वोल्टेज, जेल सांद्रता और संचालन समय से ही रिज़ॉल्यूशन निर्धारित होता है। यह विधि आणविक जीवविज्ञान प्रयोगशालाओं में मूलभूत है।

• डीएनए खंडों को आकार के आधार पर अलग करता है
• यह विद्युत क्षेत्र और छिद्रयुक्त जेल का उपयोग करता है।
• छोटे टुकड़े अधिक दूर तक यात्रा करते हैं
• फ्लोरोसेंट रंगों के साथ दृश्यीकृत