Θραύσματα DNA διαφορετικών μηκών μπορούν να διαχωριστούν με ηλεκτρικό πεδίο. Η ηλεκτροφόρηση σε γέλη έλκει φορτισμένα μόρια μέσω μιας πορώδους μήτρας γέλης. Τα μικρότερα θραύσματα μετακινούνται ταχύτερα από τα μεγαλύτερα. Το αποτέλεσμα είναι μια σειρά από ζώνες που αποκαλύπτουν τα μεγέθη που υπάρχουν σε ένα δείγμα.

Τα πηκτώματα αγαρόζης χρησιμοποιούνται για μεγαλύτερα κομμάτια DNA. Τα πηκτώματα πολυακρυλαμιδίου διαχωρίζουν μικρότερα θραύσματα. Το DNA απεικονίζεται με φθορίζουσες χρωστικές ή χρωστικές. Η σύγκριση με ένα πρότυπο μεγέθους επιτρέπει την εκτίμηση του μήκους του θραύσματος. Η τεχνική αυτή αποτελεί τη βάση της χαρτογράφησης περιορισμού, της ανάλυσης PCR και του ποιοτικού ελέγχου των βιβλιοθηκών αλληλούχισης.

Παρόλο που έχει αντικατασταθεί σε μεγάλο βαθμό από τριχοειδείς και μικρορευστομηχανικές μεθόδους για εργασίες υψηλής απόδοσης, η ηλεκτροφόρηση πλάκας-πηκτής παραμένει ένα απλό, φθηνό εργαλείο διδασκαλίας και έρευνας. Η σωστή τάση, η συγκέντρωση της γέλης και ο χρόνος εκτέλεσης καθορίζουν την ανάλυση. Η μέθοδος είναι θεμελιώδης στα εργαστήρια μοριακής βιολογίας.

• Διαχωρίζει τα θραύσματα DNA κατά μέγεθος
• Χρησιμοποιεί ηλεκτρικό πεδίο και πορώδες τζελ
• Τα μικρότερα θραύσματα ταξιδεύουν πιο μακριά
• Οπτικοποιημένο με φθορίζουσες χρωστικές