Фрагменты ДНК различной длины можно разделить с помощью электрического поля. Гель-электрофорез перемещает заряженные молекулы через пористую гелевую матрицу; более мелкие фрагменты мигрируют быстрее, чем более крупные. В результате образуется ряд полос, которые показывают размеры фрагментов, присутствующих в образце.

Агарозные гели используются для анализа более крупных фрагментов ДНК; полиакриламидные гели позволяют разделить более мелкие фрагменты. ДНК визуализируется с помощью флуоресцентных красителей или растворителей. Сравнение со стандартным образцом позволяет оценить длину фрагмента. Этот метод лежит в основе рестрикционного картирования, ПЦР-анализа и контроля качества библиотек для секвенирования.

Хотя электрофорез в пластинчатом геле в значительной степени вытеснен капиллярными и микрофлюидными методами для высокопроизводительной работы, он остается простым и недорогим инструментом для обучения и исследований. Разрешение определяется правильным напряжением, концентрацией геля и временем проведения электрофореза. Этот метод является основополагающим в лабораториях молекулярной биологии.

• Разделяет фрагменты ДНК по размеру.
• Использует электрическое поле и пористый гель.
• Более мелкие фрагменты распространяются дальше.
• Визуализация с помощью флуоресцентных красителей.