Een lagune is een ondiep watergebied dat door een barrière-eiland, zandbank of koraalrif van de open zee wordt gescheiden. Wateruitwisseling met de oceaan vindt plaats via inhammen of over de rifrand, waardoor het zoutgehalte en de temperatuur aanzienlijk kunnen verschillen van de omstandigheden op open zee.

Kustlagunes herbergen vaak zeegrasvelden, mangrovebossen en productieve visbestanden. Ze dienen als kraamkamers voor vele mariene soorten en als buffers die golfenergie absorberen en voedingsstoffen en sedimenten afkomstig van het land filteren. Menselijke nederzettingen ontstaan ​​vaak rond lagunes vanwege het beschutte water en de toegang tot zowel land- als zeebronnen.

Lagunes zijn gevoelig voor veranderingen in de zoetwateraanvoer, de stabiliteit van de inlaat en de stijging van de zeespiegel. Vervuiling en eutrofiëring kunnen de waterkwaliteit snel verslechteren door de beperkte doorstroming. Het beheer richt zich doorgaans op het behoud van de verbinding met de zee, het beheersen van de nutriëntentoevoer en het beschermen van de omliggende habitats. Elke lagune heeft een unieke balans tussen mariene en landelijke invloeden.

Bij eb kan een lagune eruitzien als een rustig meer; bij vloed herstelt de oceaan zijn verbinding.