Eine Lagune ist ein flaches Gewässer, das durch eine Barriereinsel, eine Sandbank oder ein Korallenriff vom offenen Meer getrennt ist. Der Wasseraustausch mit dem Ozean erfolgt über Buchten oder über den Riffkamm, sodass sich Salzgehalt und Temperatur deutlich von den Bedingungen im offenen Meer unterscheiden können.

Küstenlagunen beherbergen oft Seegraswiesen, Mangrovenwälder und ertragreiche Fischgründe. Sie dienen vielen Meeresarten als Kinderstube und als Puffer, der Wellenenergie absorbiert und Nährstoffe und Sedimente vom Land filtert. Aufgrund des geschützten Wassers und des Zugangs zu Land- und Meeresressourcen entstehen menschliche Siedlungen häufig in der Nähe von Lagunen.

Lagunen reagieren empfindlich auf Veränderungen des Süßwasserzuflusses, der Stabilität der Zuflüsse und des Meeresspiegelanstiegs. Verschmutzung und Eutrophierung können die Wasserqualität aufgrund des begrenzten Wasseraustauschs rasch verschlechtern. Das Management konzentriert sich typischerweise auf die Aufrechterhaltung der Verbindung zum Meer, die Kontrolle des Nährstoffeintrags und den Schutz der angrenzenden Lebensräume. Jede Lagune weist ein einzigartiges Gleichgewicht mariner und terrestrischer Einflüsse auf.

Bei Ebbe kann eine Lagune wie ein ruhiger See aussehen; bei Flut stellt der Ozean seine Verbindung wieder her.