宗教当局が直接統治する場合、あるいは法律が世俗的な介入なしに宗教教義から明確に導き出される場合、その体制は神権政治である。政治的指導と精神的指導は融合しているか、密接に連携している。

歴史上の神政政治の例としては、教皇による統治の特定の時期やカルヴァンのジュネーブなどが挙げられる。現代においても、聖職者組織が立法や公職に対して拒否権を持つ例、あるいは部分的な例が見られる。神政政治の主張は、民衆の同意や世襲権のみに基づくのではなく、神の権威に基づいている。

神権政治は宗教的異議を制限し、しばしば聖なる法に基づいて個人の行動を規制する。信者間の強い社会的結束をもたらす一方で、非信者や現代の個人の権利に対する期待との間に摩擦を生むこともある。神権政治からの移行は、政治体制だけでなく正当性の根源そのものにも挑戦するため、通常は論争を伴う。

神政政治においては、支配者に異議を唱えることは、神の秩序そのものに異議を唱えることとみなされる可能性がある。