जीन स्वतः सक्रिय नहीं होते। प्रमोटर जीन के ठीक ऊपर स्थित डीएनए का एक भाग होता है, जहाँ आरएनए पॉलीमरेज़ और ट्रांसक्रिप्शन कारक मिलकर ट्रांसक्रिप्शन शुरू करते हैं। इसकी अनुक्रम निर्धारित करता है कि जीन कितनी तीव्रता से और किन परिस्थितियों में व्यक्त होगा।

टाटा बॉक्स जैसे कोर प्रमोटर तत्व पॉलीमरेज़ को सही स्थिति में रखने में मदद करते हैं। दूर स्थित एनहांसर और साइलेंसर तत्व गतिविधि में शामिल होकर उसे नियंत्रित कर सकते हैं। बैक्टीरिया में, प्रमोटर अक्सर छोटे और अधिक एकसमान होते हैं; जबकि यूकेरियोटिक प्रमोटर लंबे और अधिक जटिल होते हैं, जिनमें कई नियामक संकेत एकीकृत होते हैं।

प्रमोटर क्षेत्रों में उत्परिवर्तन जीन अभिव्यक्ति को काफी हद तक कम या ज्यादा कर सकते हैं और रोग उत्पन्न कर सकते हैं। शोधकर्ता किसी जीन की सक्रियता को नियंत्रित करने के लिए ज्ञात शक्ति के प्रमोटरों को इंजीनियर संरचनाओं में सम्मिलित करते हैं। जीन विनियमन को समझने में प्रमोटर संरचना का मानचित्रण एक महत्वपूर्ण कार्य बना हुआ है।

• जीन प्रतिलेखन को प्रारंभ करने वाला डीएनए क्षेत्र
• आरएनए पॉलीमरेज़ और ट्रांसक्रिप्शन कारकों को बांधता है
• अभिव्यक्ति की तीव्रता और समय को नियंत्रित करता है
• बैक्टीरिया और यूकेरियोट्स के बीच जटिलता में भिन्नता पाई जाती है।