Živočišný plankton – unášené organismy, které neumí plavat proti proudům – je známý jako zooplankton. Patří mezi ně drobní prvoci a larvální stádia ryb a bezobratlých až po větší krill, medúzy a salpy. Většina se živí fytoplanktonem nebo jiným zooplanktonem a tvoří tak klíčové články v mořských potravních sítích.

Mnoho zooplanktonů podniká denní vertikální migrace, v noci stoupají k hladině, aby se nakrmili, a ve dne sestupují, aby se vyhnuli predátorům. Toto chování představuje jeden z největších synchronizovaných pohybů zvířat na Zemi. Biomasa zooplanktonu a složení společenstev rychle reagují na změny teploty, produktivity a predace, což z nich činí citlivé indikátory stavu ekosystému.

Vzorkování tradičně využívá sítě s různými velikostmi ok; optické a akustické metody a analýza environmentální DNA rozšiřují pozorovací kapacitu. Protože zooplankton přenáší energii z primárních producentů na ryby a mořské savce, jeho dynamika ovlivňuje produktivitu rybolovu a účinnost biologické uhlíkové pumpy.

• Živočišná složka planktonu
• Propojení fytoplanktonu s vyššími trofickými úrovněmi
• Mnoho z nich migruje vertikálně každý den
• Citlivé indikátory změn oceánů