システムがドメインについて推論を行うには、共通の語彙が必要です。オントロジーは、ドメイン内の概念、概念間の関係、および概念の組み合わせ方を規定する規則を定めます。それは意味の形式的な設計図と言えるでしょう。

オントロジーは分類体系とは異なります。分類体系は物事をカテゴリーに分類するのに対し、オントロジーは特性、関係性、論理公理を追加します。例えば、遺伝子オントロジーでは、遺伝子は定義された関係性を通して、分子機能、生物学的プロセス、細胞構成要素と結び付けられています。

共通オントロジーコンポーネント

• 概念を表すクラス
• 属性を記述するプロパティ
• エンティティを連結する関係
• 解釈を制約する公理
• モデルを構成するインスタンス

オントロジーの構築には長年の歳月と専門家による共同作業が必要です。一度構築されると、オントロジーはデータ統合、セマンティック検索、自動推論をサポートします。これらは生物医学情報学の基盤であり、ますます企業知識システムの中核にもなっています。