Chemické značky mohou umlčet geny bez změny základní sekvence. Metylace DNA je přidání methylové skupiny, obvykle k cytosinovým bázím v CpG dinukleotidech. Silná metylace v promotorových oblastech typicky potlačuje transkripci.

Vzorec metylace se vytváří během vývoje a lze jej udržovat buněčným dělením pomocí enzymů methyltransferáz. Profily metylace mění faktory prostředí, věk a chorobné stavy. Abnormální metylace přispívá k rakovině umlčováním genů potlačujících nádory nebo aktivací onkogenů.

Výzkumníci mapují metylaci pomocí bisulfitového sekvenování a metod založených na čipech. U savců je metylace nezbytná pro inaktivaci chromozomu X a genomový imprinting. Demetylační léky se používají v některých terapiích rakoviny k reaktivaci umlčených genů. Značka je reverzibilní, což propojuje vliv prostředí s dlouhodobou regulací genů.

• Přidání methylových skupin k DNA
• Obvykle se vyskytuje v místech CpG
• Často potlačuje genovou expresi
• Dědičné buněčným dělením