لا بد من وجود جهة تدير الميناء كنظام متكامل. وهيئة الميناء هي المنظمة - العامة أو الخاصة - المسؤولة عن إدارة البنية التحتية للميناء وعملياته وسلامته، وغالباً ما تكون مسؤولة عن تطويره التجاري.

تشمل الوظائف عادةً صيانة القنوات والأرصفة، وتخصيص المساحات البرية والمائية، وتحديد الرسوم، وإنفاذ اللوائح، وتنسيق عمل المرشدين البحريين وقوارب القطر والأمن. بعض السلطات تدير المحطات بنفسها، بينما تعمل سلطات أخرى كمؤجرين لمشغلي المحطات من القطاع الخاص. وتختلف نماذج الحوكمة اختلافًا كبيرًا بين الدول.

تُوازن هيئات الموانئ الفعّالة بين النمو التجاري والسلامة وحماية البيئة. وهي الجهة الرئيسية التي يتواصل معها مشغلو السفن بشأن القواعد المحلية والرسوم ومستويات الخدمة. وتُؤثر قرارات الاستثمار التي تتخذها الهيئة على الوضع التنافسي للميناء لعقود.

• المنظمة التي تدير البنية التحتية والعمليات الخاصة بالميناء
• يتولى مسؤولية السلامة والتعريفات الجمركية وتخصيص المساحات
• قد يقوم بتشغيل المحطات أو العمل كمالك للعقار.
• يُحدد القدرة التنافسية طويلة الأجل للميناء