Chromosomy nie przechodzą niezmienione od rodzica do potomka. Rekombinacja przekształca materiał genetyczny, najczęściej poprzez crossing-over między homologicznymi chromosomami podczas mejozy. Wymiana tworzy nowe kombinacje alleli na tym samym chromosomie.

Fizyczne pękanie i ponowne łączenie zachodzą w chiazmach. Im dalej od siebie znajdują się dwa loci, tym większe prawdopodobieństwo wystąpienia między nimi crossovera; ta zależność umożliwia budowę map genetycznych. Rekombinacja pomaga również chromosomom w prawidłowej segregacji, utrzymując homologi razem aż do anafazy.

Błędy w rekombinacji mogą prowadzić do delecji, duplikacji lub translokacji. W układzie odpornościowym wyspecjalizowana rekombinacja powoduje powstawanie różnorodnych genów przeciwciał. Proces ten jest zatem zarówno źródłem różnorodności, jak i potencjalną przyczyną niestabilności genomu.

• Przegrupowanie materiału genetycznego
• Występuje głównie poprzez crossing-over w mejozie
• Generuje nowe kombinacje alleli
• Niezbędne do mapowania genetycznego i różnorodności