Chromosomen werden nicht unverändert von den Eltern an die Nachkommen weitergegeben. Durch Rekombination wird das genetische Material neu angeordnet, meist durch Crossing-over zwischen homologen Chromosomen während der Meiose. Dieser Austausch erzeugt neue Allelkombinationen auf demselben Chromosom.

Physische Brüche und Wiedervereinigungen finden an Chiasmata statt. Je weiter zwei Loci voneinander entfernt liegen, desto wahrscheinlicher ist ein Crossing-over zwischen ihnen; diese Beziehung ermöglicht die Erstellung genetischer Karten. Rekombination trägt außerdem zur korrekten Trennung der Chromosomen bei, indem sie homologe Chromosomen bis zur Anaphase zusammenhält.

Fehler bei der Rekombination können Deletionen, Duplikationen oder Translokationen verursachen. Im Immunsystem werden durch spezialisierte Rekombination verschiedene Antikörpergene zusammengesetzt. Dieser Prozess ist daher sowohl eine Quelle der genetischen Vielfalt als auch eine potenzielle Ursache für genomische Instabilität.

• Neuanordnung des genetischen Materials
• Findet primär durch Crossing-over während der Meiose statt.
• Erzeugt neue Allelkombinationen
• Unverzichtbar für die genetische Kartierung und Diversität