A kromoszómák nem változatlanul öröklődnek a szülőről az utódra. A rekombináció átrendezi a genetikai anyagot, leggyakrabban a homológ kromoszómák közötti meiózis során történő átkereszteződés révén. A csere során az allélok új kombinációi jönnek létre ugyanazon a kromoszómán.

A fizikai törés és újraegyesülés a chiasmáknál történik. Minél távolabb helyezkedik el két lókusz egymástól, annál valószínűbb, hogy kereszteződés történik közöttük; ez a kapcsolat lehetővé teszi a genetikai térképek felépítését. A rekombináció a kromoszómák megfelelő szegregálódását is segíti azáltal, hogy a homológokat az anafázisig együtt tartja.

A rekombinációs hibák deléciókat, duplikációkat vagy transzlokációkat okozhatnak. Az immunrendszerben a specializált rekombináció különféle antitestgéneket állít össze. A folyamat ezért egyszerre a diverzitás forrása és a genomiális instabilitás potenciális oka.

• A genetikai anyag átrendeződése
• Elsősorban a meiózis során crossing over útján történik
• Új allélkombinációkat generál
• Alapvető a genetikai térképezéshez és a sokféleséghez