细菌通常会协调相关基因的表达。操纵子是由一组基因组成，它们在共同的启动子和操纵序列的控制下，共同转录成一条单一的信使RNA。大肠杆菌的乳糖操纵子就是一个典型的例子。

当阻遏蛋白与操纵序列结合时，转录被阻断。诱导分子或其他信号解除阻遏，使基因得以表达。这种高效的机制使细胞能够快速响应环境变化，例如营养物质的供应。

操纵子在真核生物中较为罕见，因为真核生物的基因通常是单独转录的。合成生物学家构建人工操纵子，以在工程化的回路中控制多个基因。这一概念对于理解原核生物基因调控仍然至关重要。

• 共转录细菌基因簇
• 由同一发起人和运营者控制
• 允许协调表达
• 经典的例子是乳糖操纵子。