Inne i vevet til mange koraller, kjempemuslinger og anemoner lever encellede alger kjent som zooxanthellae. Disse dinoflagellatene utfører fotosyntese og overfører en stor andel av de resulterende organiske forbindelsene til verten sin, som igjen gir beskyttelse og tilgang til næringsstoffer i ellers næringsfattige tropiske farvann.

Partnerskapet er grunnlaget for korallrevets produktivitet. Zooksantheller bidrar også til de livlige fargene til sunne koraller. Når koraller stresses av varme eller andre faktorer, kan de skille ut zooxantheller og blekemiddel, og miste både farge og sin viktigste energikilde. Ulike genetiske typer zooxantheller gir varierende grader av varmetoleranse, et faktum som ligger til grunn for noen strategier for restaurering av rev.

Forholdet er en obligatorisk symbiose for revbyggende koraller i grunt vann; uten zooxantheller kan de ikke avsette kalsiumkarbonat raskt nok til å bygge rev. Å studere mangfoldet og fysiologien til disse algene er sentralt for å forstå hvordan rev kan reagere på et varmere hav.

En enkelt korallpolypp kan være vert for millioner av zooxanthellae-celler i vevet sitt.