Μερικές φορές και τα δύο κληρονομημένα αντίγραφα ενός γονιδίου είναι πανομοιότυπα. Ο όρος ομόζυγο περιγράφει την κατάσταση κατά την οποία υπάρχουν δύο από το ίδιο αλληλόμορφο σε μια συγκεκριμένη θέση. Τα αλληλόμορφα μπορεί να είναι και τα δύο κυρίαρχα ή και τα δύο υπολειπόμενα.

Τα ομόζυγα κυρίαρχα άτομα εκφράζουν τον κυρίαρχο φαινότυπο. Τα ομόζυγα υπολειπόμενα άτομα εκφράζουν τον υπολειπόμενο φαινότυπο. Για τις υπολειπόμενες διαταραχές, μόνο ο ομόζυγος υπολειπόμενος γονότυπος προκαλεί την ασθένεια. Η ενδογαμία αυξάνει την πιθανότητα ομοζυγωτίας για σπάνια αλληλόμορφα.

Οι γενετικές εξετάσεις αναφέρουν ομόζυγους γονότυπους όταν ανιχνεύεται μόνο ένα αλληλόμορφο. Η χαρτογράφηση της ομοζυγωτίας βοηθά στην αναγνώριση υπολειπόμενων γονιδίων ασθενειών σε οικογένειες με συγγένεια εξ αίματος. Η έννοια αυτή είναι απαραίτητη για την πρόβλεψη των Μεντελικών αναλογιών και την κατανόηση της γενετικής σύνθεσης των πληθυσμών.

• Έχοντας δύο πανομοιότυπα αλληλόμορφα σε έναν τόπο
• Μπορεί να είναι κυρίαρχο ή υπολειπόμενο
• Απαραίτητο για την έκφραση υπολειπόμενων χαρακτηριστικών
• Αυξημένη λόγω συγγένειας των γονέων