大腦皮質下方隱藏著一組相互連接的神經核團，它們幫助選擇和啟動運動，同時抑制其他競爭性運動。基底神經節也參與程序性學習和獎勵評估。

此迴路的主要組成部分包括紋狀體、蒼白球、丘腦底核和黑質。皮質輸入主要到達紋狀體；輸出最終影響丘腦和腦幹運動中樞。迴路內的直接和間接路徑提供了一種推拉機制，用於促進或抑制運動。

黑質多巴胺能神經元的退化會導致帕金森氏症的運動症狀。其他疾病，例如亨丁頓舞蹈症和某些類型的肌張力失調，也與基底核迴路有關。對這些結構進行深部腦部刺激可以緩解部分患者的症狀，凸顯了其臨床重要性。

• 調控運動選擇的細胞核群
• 參與獎勵和習慣學習
• 帕金森氏症和亨廷頓氏症的紊亂
• 深部腦部刺激的目標