Begravet under cortex ligger et sæt sammenkoblede kerner, der hjælper med at udvælge og initiere bevægelser, samtidig med at de undertrykker konkurrerende. Basalganglierne bidrager også til proceduremæssig læring og til evaluering af belønninger.

Hovedkomponenterne omfatter striatum, globus pallidus, nucleus subthalamus og substantia nigra. Kortikale input ankommer primært til striatum; output påvirker i sidste ende thalamus og hjernestammens motorcentre. De direkte og indirekte signaler i kredsløbet fungerer som en push-pull-mekanisme til at fremme eller hæmme bevægelse.

Degeneration af dopaminneuroner i substantia nigra forårsager de motoriske symptomer ved Parkinsons sygdom. Andre lidelser, såsom Huntingtons sygdom og visse former for dystoni, involverer også basalgangliernes kredsløb. Dyb hjernestimulation af disse strukturer kan lindre symptomer hos udvalgte patienter, hvilket understreger deres kliniske betydning.

• Gruppe af kerner, der regulerer bevægelsesudvælgelse
• Involveret i belønning og vaneindlæring
• Forstyrret ved Parkinsons og Huntingtons
• Mål for dyb hjernestimulering