某些藻类大量繁殖时，会使水体变色，呈现红色、棕色或橙色。这种现象通常被称为赤潮，但这个术语并不准确，并非所有有害藻类都会使水体变红。这种变色现象源于藻类（通常是甲藻）的辅助色素。

某些赤潮物种会产生强效毒素，这些毒素会在贝类体内积聚或直接杀死鱼类。另一些赤潮物种则会在腐烂过程中消耗氧气。在赤潮严重时，沿海社区可能会关闭海滩和贝类养殖场。营养物质富集、温暖稳定的水体以及沉积物中休眠孢囊的存在都可能促进赤潮的发生发展。

监测项目利用显微镜、毒素检测和卫星图像来追踪赤潮并发布公众预警。由于生物学和物理学之间复杂的相互作用，预测赤潮发生的确切时间和地点仍然十分困难。减少长期营养污染可以降低最严重赤潮事件发生的概率。

• 藻类大量繁殖导致水体变色
• 通常由甲藻引起
• 有些物种会产生有害毒素。
• 监测以保护公众健康