ミミズは貧毛綱に属する土壌生息性の環形動物で、水分と有機物が存在するほとんどの陸上生態系に生息しています。農業でよく見られる種としては、ヨーロッパミミズ（Lumbricus terrestris）、アカミミズ（Eisenia fetida）、ハイイロミミズ（Aporrectodea caliginosa）などがあります。ミミズは腐敗した有機物や土壌を餌とし、消化管を通して栄養豊富な糞を排泄します。ミミズが穴を掘ることで土壌の通気性が向上し、水の浸透性が高まり、有機物が混ざり合い、土壌構造が強化されます。チャールズ・ダーウィンの1881年の著書『ミミズの働きによる腐植土の形成』は、ミミズの重要性を最初に認識した書籍の一つです。ミミズは耕作、農薬、酸性度、有機物不足に敏感であるため、ミミズの存在は土壌の健康状態を示す良い指標となります。ミミズ堆肥化では、アカミミズを使って食品残渣や糞尿を堆肥に変換します。ミミズは炭素と窒素の循環にも貢献し、鳥類、モグラ、その他の野生動物の食料源にもなる。