孟德尔注意到不同的性状不会一起遗传。独立分配定律指出，不同基因的等位基因在配子形成过程中彼此独立分离。一个配子从一个基因获得的等位基因不会影响它从另一个基因获得的等位基因。
其物理基础是减数分裂I中期不同染色体对的随机排列。因此，位于不同染色体上的基因独立分配。位于同一条染色体上彼此靠近的基因则具有遗传连锁性，并偏离独立分配定律。
该定律预测双杂交中会出现经典的9:3:3:1比例。连锁作图和重组频率量化了基因独立分离的频率。现代遗传学在分析多个性状或基因位点的遗传时仍然依赖于这一原理。
- 不同基因的等位基因独立进行基因分选。
- 发生在减数分裂过程中
- 对于不同染色体上的基因而言，情况确实如此。
- 双杂交后代比例为9:3:3:1
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