Mendel observou que características diferentes não eram transmitidas em conjunto. A lei da segregação independente afirma que os alelos de diferentes genes segregam independentemente uns dos outros durante a formação dos gâmetas. O alelo que um gâmeta recebe para um gene não influencia o alelo que recebe para outro gene.

A base física reside na orientação aleatória dos diferentes pares de cromossomas na metáfase I da meiose. Os genes localizados em cromossomas diferentes, portanto, segregam-se independentemente. Os genes que estão próximos uns dos outros no mesmo cromossoma estão geneticamente ligados e desviam-se da segregação independente.

A lei prevê a proporção clássica de 9:3:3:1 nos cruzamentos di-híbridos. O mapeamento de ligação e as frequências de recombinação quantificam a frequência com que os genes se segregam independentemente. A genética moderna ainda se baseia neste princípio quando analisa a herança de múltiplas características ou loci.

• Os alelos de diferentes genes segregam-se independentemente.
• Ocorre durante a meiose
• Verdadeiro para genes em cromossomas diferentes.
• Produz rácios de 9:3:3:1 em cruzamentos di-híbridos.