Mendel a constaté que les caractères différents ne se transmettaient pas simultanément. La loi de l'assortiment indépendant stipule que les allèles de différents gènes se séparent indépendamment les uns des autres lors de la formation des gamètes. L'allèle qu'un gamète reçoit pour un gène donné n'influence pas l'allèle qu'il reçoit pour un autre gène.

Le principe physique sous-jacent est l'orientation aléatoire des différentes paires de chromosomes lors de la métaphase I de la méiose. Les gènes situés sur des chromosomes différents s'assortissent donc indépendamment. Les gènes proches l'un de l'autre sur le même chromosome sont génétiquement liés et ne s'assortissent pas indépendamment.

Cette loi prédit le ratio classique 9:3:3:1 dans les croisements dihybrides. La cartographie de liaison et les fréquences de recombinaison permettent de quantifier la fréquence à laquelle les gènes s'assortissent indépendamment. La génétique moderne repose encore sur ce principe pour analyser l'hérédité de plusieurs caractères ou loci.

• Les allèles de différents gènes s'assortissent indépendamment
• Se produit lors de la méiose
• C'est vrai pour les gènes situés sur des chromosomes différents.
• Produit des ratios 9:3:3:1 dans les croisements dihybrides