Mendel la merke til at forskjellige egenskaper ikke beveget seg sammen. Loven om uavhengig assortering sier at alleler av forskjellige gener segregerer uavhengig av hverandre under gametdannelse. Allelet en gamet mottar for ett gen påvirker ikke allelet den mottar for et annet gen.

Det fysiske grunnlaget er den tilfeldige orienteringen av forskjellige kromosompar i metafase I av meiosen. Gener som ligger på forskjellige kromosomer sorterer derfor uavhengig. Gener som er tett sammen på samme kromosom er genetisk lenket og avviker fra uavhengig sortering.

Loven forutsier det klassiske forholdet 9:3:3:1 i dihybridkrysninger. Koblingskartlegging og rekombinasjonsfrekvenser kvantifiserer hvor ofte gener sorteres uavhengig. Moderne genetikk er fortsatt avhengig av dette prinsippet når man analyserer arv av flere egenskaper eller loci.

• Alleler av forskjellige gener sorteres uavhengig
• Oppstår under meiose
• Sant for gener på forskjellige kromosomer
• Produserer forholdstall på 9:3:3:1 i dihybridkryss