कृषि पारिस्थितिकी, कृषि प्रणालियों के डिजाइन और प्रबंधन में पारिस्थितिक सिद्धांतों का अनुप्रयोग है। यह खेतों को पारिस्थितिकी तंत्र के रूप में देखती है, और जैव विविधता, पोषक तत्व चक्रण, मृदा स्वास्थ्य, प्राकृतिक कीट नियंत्रण और लचीलेपन पर जोर देती है, न कि बाहरी रासायनिक इनपुट पर निर्भरता पर। इस शब्द का प्रयोग सर्वप्रथम 1920 के दशक में रूसी कृषि वैज्ञानिक बेसिल बेन्सिन ने किया था और 1970 और 1980 के दशक में मिगुएल अल्टीरी और स्टीफन ग्लिसमैन जैसे वैज्ञानिकों के कार्यों के माध्यम से इसे प्रमुखता मिली, जिन्होंने पारिस्थितिक सिद्धांत को पारंपरिक कृषि ज्ञान से जोड़ा। कृषि पारिस्थितिकी में अंतर्फसल खेती, फसल चक्र, आवरण फसल, कृषि वानिकी, एकीकृत कीट प्रबंधन और खाद बनाने जैसी पद्धतियाँ शामिल हैं। कृषि विज्ञान से परे, यह एक सामाजिक और राजनीतिक आंदोलन बन गया है जो खाद्य संप्रभुता, किसान-नेतृत्व वाले अनुसंधान और न्यायसंगत खाद्य प्रणालियों की वकालत करता है, विशेष रूप से लैटिन अमेरिका में ला विया कैम्पेसिना जैसे संगठनों के माध्यम से। 2014 में, एफएओ ने सतत खाद्य उत्पादन के मार्ग के रूप में कृषि पारिस्थितिकी को मान्यता देने के लिए अंतर्राष्ट्रीय संगोष्ठियों का आयोजन किया। इसके समर्थक बेहतर मृदा कार्बन, कम इनपुट लागत और जलवायु परिवर्तन के प्रति लचीलेपन का हवाला देते हैं; आलोचक संभावित उपज संबंधी कमियों और श्रम-प्रधान विधियों को औद्योगिक स्तर पर लागू करने की चुनौती की ओर ध्यान दिलाते हैं।