Kloning gen menghasilkan salinan gen tertentu. Ini berbeda dengan kloning organisme. Kloning gen adalah teknik biologi molekuler yang digunakan untuk mengisolasi gen, memasukkannya ke dalam vektor, dan memperbanyaknya dalam sel inang. Hasilnya adalah banyak salinan gen yang identik, yang dapat dipelajari, diurutkan, atau digunakan untuk menghasilkan protein.

Proses ini terdiri dari beberapa langkah. Gen diperbanyak dengan PCR atau dipotong dari molekul DNA yang lebih besar dengan enzim restriksi. Gen tersebut dimasukkan ke dalam vektor, biasanya plasmid, menggunakan ligase. Vektor dimasukkan ke dalam sel inang, seringkali E. coli, melalui transformasi. Sel inang berkembang biak, dan plasmid bereplikasi bersamanya. Sel yang mengandung plasmid dipilih, biasanya dengan penanda resistensi antibiotik. Gen kemudian diisolasi dari sel inang.

Kloning gen digunakan untuk memproduksi insulin, hormon pertumbuhan, dan protein terapeutik lainnya. Teknik ini digunakan untuk mempelajari fungsi gen dengan mengekspresikan gen tersebut dalam organisme model. Kloning gen juga digunakan untuk menciptakan tanaman dan hewan hasil rekayasa genetika. Ini merupakan teknik dasar bioteknologi.

Teknik ini bukannya tanpa tantangan. Beberapa gen sulit dikloning karena bersifat toksik bagi inang atau tidak stabil. Gen lainnya membutuhkan vektor atau strain inang khusus. Namun untuk sebagian besar gen, kloning adalah hal yang rutin. Ini adalah langkah pertama dalam banyak eksperimen.