प्रत्येक व्यक्ति में किसी दिए गए जीन के लिए दो एलील होते हैं, फिर भी युग्मकों को केवल एक ही प्राप्त होता है। पृथक्करण का नियम कहता है कि युग्मक निर्माण के दौरान दोनों एलील स्पष्ट रूप से अलग हो जाते हैं, जिससे प्रत्येक युग्मक को ठीक एक ही एलील प्राप्त होता है। निषेचन के बाद यह युग्म फिर से जुड़ जाता है।

मेंडल ने एकसंकर संकरणों से इस नियम का प्रतिपादन किया, जिनसे दूसरी पीढ़ी में 3:1 का समरूपी अनुपात प्राप्त हुआ। इसका कोशिकावैज्ञानिक आधार अर्धसूत्री विभाजन के प्रथम चरण के दौरान समजात गुणसूत्रों का पृथक्करण है। बाद में अर्धसूत्री विभाजन द्वितीय में सहोदर गुणसूत्र अलग हो जाते हैं।

पृथक्करण यह सुनिश्चित करता है कि आनुवंशिक जानकारी मिश्रण के बजाय एक पूर्वानुमानित, कणिकीय तरीके से प्रसारित हो। नॉनडिसजंक्शन जैसे अपवाद एन्यूप्लोइडी उत्पन्न करते हैं। यह सिद्धांत शास्त्रीय आनुवंशिकी का एक आधारशिला बना हुआ है और आनुवंशिक परामर्श में जोखिम गणना का आधार है।

• युग्मक निर्माण के दौरान एलील अलग हो जाते हैं
• प्रत्येक युग्मक को एक एलील प्राप्त होता है
• मोनोहाइब्रिड क्रॉस में 3:1 अनुपात की व्याख्या करता है
• समजात गुणसूत्र पृथक्करण के आधार पर