Ett marint ekosystem omfattar det samverkande samfundet av organismer och den fysiska och kemiska miljö de lever i. Gränser kan dras runt en tidvattenbassäng, en kelpskog, ett korallrev, en flodmynning eller en hel havsbassäng, beroende på intressets skala.

Energi kommer vanligtvis in genom fotosyntes av fytoplankton, sjögräs eller sjögräs, eller genom kemosyntes vid öppningar och sippringar. Näringsämnen, ljus, temperatur och substrat formar samhällets struktur. Återkopplingar mellan organismer och deras omgivning – såsom revbyggande av koraller eller sedimentstabilisering av sjögräs – skapar livsmiljöer som ytterligare påverkar vilka som kan leva där.

Marina ekosystem tillhandahåller mat, kustskydd, koldioxidlagring och kulturellt värde. De är under samtidig press från fiske, föroreningar, uppvärmning, försurning och förstörelse av livsmiljöer. Ekosystembaserad förvaltning försöker upprätthålla integriteten hos dessa system snarare än att fokusera på enskilda arter. Långsiktiga observationer är avgörande för att skilja naturlig variation från riktningsförändringar.

Även en liten plätt sjögräs fungerar som ett självständigt ekosystem med sina egna producenter, konsumenter och nedbrytare.