Un ecosistema marino comprende la comunidad de organismos que interactúan entre sí y el entorno físico y químico en el que viven. Los límites pueden establecerse alrededor de una poza de marea, un bosque de algas, un arrecife de coral, un estuario o una cuenca oceánica completa, según la escala de interés.

La energía generalmente ingresa a través de la fotosíntesis realizada por el fitoplancton, las algas o las praderas marinas, o a través de la quimiosíntesis en fuentes hidrotermales y filtraciones. Los nutrientes, la luz, la temperatura y el sustrato dan forma a la estructura de la comunidad. Las interacciones entre los organismos y su entorno, como la formación de arrecifes por los corales o la estabilización de sedimentos por las praderas marinas, crean hábitats que, a su vez, influyen en quiénes pueden vivir allí.

Los ecosistemas marinos proporcionan alimento, protección costera, almacenamiento de carbono y valor cultural. Sin embargo, se ven sometidos simultáneamente a la presión de la pesca, la contaminación, el calentamiento global, la acidificación y la destrucción del hábitat. La gestión basada en los ecosistemas busca mantener la integridad de estos sistemas en lugar de centrarse en especies individuales. Las observaciones a largo plazo son esenciales para distinguir la variabilidad natural del cambio direccional.

Incluso una pequeña extensión de pastos marinos funciona como un ecosistema autónomo con sus propios productores, consumidores y descomponedores.