Um ecossistema marinho compreende a comunidade de organismos que interagem entre si e o meio físico e químico em que vivem. Os limites podem ser definidos em torno de uma poça de maré, uma floresta de algas, um recife de coral, um estuário ou uma bacia oceânica inteira, dependendo da escala de interesse.

A energia entra normalmente através da fotossíntese realizada pelo fitoplâncton, algas marinhas ou ervas marinhas, ou através da quimiossíntese em fontes hidrotermais e emanações de água. Os nutrientes, a luz, a temperatura e o substrato moldam a estrutura da comunidade. As interações entre os organismos e o seu meio ambiente — como a formação de recifes por corais ou a estabilização de sedimentos por ervas marinhas — criam habitats que influenciam ainda mais quem ali pode viver.

Os ecossistemas marinhos fornecem alimento, proteção costeira, armazenamento de carbono e valor cultural. Sofrem pressões simultâneas da pesca, da poluição, do aquecimento global, da acidificação e da destruição de habitats. A gestão baseada nos ecossistemas procura manter a integridade destes sistemas, em vez de se concentrar nas espécies individuais. As observações a longo prazo são essenciais para distinguir a variabilidade natural da mudança direcional.

Mesmo uma pequena área de ervas marinhas funciona como um ecossistema auto-suficiente, com os seus próprios produtores, consumidores e decompositores.