德謨克利特在古希臘提出了物質由微小且不可分割的粒子所構成的理論。他稱這些粒子為“atomos”，意為不可分割。這個理論沉寂了兩千年，直到1803年約翰·道爾頓將其重新提出。原子並非不可分割。它們由質子和中子組成的原子核以及圍繞其旋轉的電子雲構成。但它們是保持元素化學性質的最小單元。

原子大部分是空的空間。原子核非常小，直徑約為原子直徑的十萬分之一，但卻包含了原子幾乎所有的質量。質子帶正電，中子不帶電，電子帶負電，並佔據原子核周圍的軌道。質子數決定元素種類，中子數決定同位素種類，電子數決定電荷。

原子結合形成化合物和分子。它們透過共享電子（共價鍵）或轉移電子（離子鍵）形成鍵。電子的排列方式，尤其是最外層電子的排列方式，決定了原子的化學性質。元素週期表根據元素的原子序數和電子排布對其進行排列，揭示了化學性質的規律。

原子並非實心球體，而是由波函數描述的量子力學系統。電子並不像行星那樣圍繞原子運行，它們存在於機率雲中。原子只是一個模型，而且這個模型一直在演化，隨著我們了解的深入，它會繼續演化。