Hàng hóa vượt biên giới phải chịu sự kiểm tra và đóng thuế. Hải quan là cơ quan chính phủ chịu trách nhiệm kiểm soát dòng chảy hàng hóa ra vào một quốc gia, thu thuế và phí, và thực thi các quy định xuất nhập khẩu.

Các tàu phải nộp bản kê khai hàng hóa và tờ khai hải quan trước hoặc khi đến cảng. Nhân viên hải quan có thể lên tàu, kiểm tra hàng hóa và cho phép tàu dỡ hoặc xếp hàng. Buôn lậu, khai báo sai và hàng hóa bị cấm là những ưu tiên thực thi pháp luật. Thông thường, cần phải có sự cho phép của hải quan trước khi hàng hóa được phép rời khỏi khu vực cảng.

Việc chậm trễ trong quá trình thông quan ảnh hưởng đến toàn bộ chuỗi logistics. Hệ thống kiểm tra trước khi nhập cảnh điện tử đã giảm bớt giấy tờ tại nhiều cảng, nhưng việc kiểm tra thực tế vẫn diễn ra. Hồ sơ chính xác và sự hợp tác với đại lý tàu biển sẽ giúp đẩy nhanh quá trình.

• Cơ quan quản lý nhập khẩu, xuất khẩu và thuế quan.
• Kiểm tra tàu, hàng hóa và tờ khai hải quan.
• Cấp phép cho việc vận chuyển hàng hóa
• Thi hành các quy định về thương mại và cấm đoán.